Makhathini ist als Pädagoge und Forscher tätig und leitet die Musikabteilung der Fort Hare University im Ostkap. Er ist auf renommierten Festivals aufgetreten, darunter das Capetown International Jazz Festival und das Essence Festival (sowohl in New Orleans als auch in Südafrika), und gab 2019 sein Debüt im Blue Note Jazz Club in New York City sowie im Jazz at Lincoln Center, wo er zusammen mit Wynton Marsalis und dem Jazz at Lincoln Center Orchestra bei der dreitägigen musikalischen Feier The South African Songbook im Rose Theater zu Gast war. Er ist Mitglied von Shabaka Hutchings‘ Band Shabaka and the Ancestors, auf deren Album Wisdom of Elders (2016) er zu hören ist, und hat außerdem mit Künstlern wie Logan Richardson, Nasheet Waits, Tarus Mateen, Stefon Harris, Billy Harper, Azar Lawrence und Ernest Dawkins zusammengearbeitet.